1、供奉对象不同：寺主要受佛家影响，所以供奉的大多是佛像和菩萨，但是庙则大多是传说中的鬼神，比如土地庙、城隍庙等。2、用途不同：寺现在大多是佛教弟子居住在其中，进行修炼和学习，而庙中的僧侣却很少，大部分都是只有一个神像，经常会有人来进行祭拜，求神保佑。
3、文化不同：寺是佛教文化的基地，因为在古文中，“寺”有着持续的含义，而古代的大部分皇帝都将佛教的传播，视为一个永久性的事业，而庙则是迷信的成分偏多，都是传说中塑造的神明形象。4、发源不同：寺最早是朝廷官吏任职的场所，比如大理寺，太常寺等，而庙则最初是百姓进行祭祖的地方，比如家族的祠堂，就被称为家庙，还有皇帝的家庙，又被称为太庙。
从广义上来说，寺庙不仅仅与佛教有关。但在佛教中，寺庙就有许多种称谓：如“寺”，最初并不是指佛教寺庙，从秦代以来通常将官舍称为寺。在汉代把接待从西方来的高僧居住的地方也称为寺，从此之后，“寺”便逐渐成为中国佛教建筑的专称。“寺”是佛教传到中国后，中国人为尊重佛教，对佛教建筑的新称呼。如白马寺、大召寺等。除此之外，如庵，那是尼姑居住的寺庙。
